《明朝那些事》第六册对万历后三十年的政治斗争，尤其是由“争国本”引起的晚明三大案，进行了细致深刻的描写。作者当年明月反复分析《明史》等正史史料，以探寻晚明三大著名疑案 “打闷棍”、“妖书”及“红丸”的历史真相，并在书中推断出可靠的答案。明月坚持读史，要读史料说真相，而不是一味重复原有观点，不管是清流东林党的掌权之术，还是清朝开国皇帝努尔哈赤的发家史，甚至民族英雄袁崇焕的性格缺陷，明月都坚持以史料说话，将历史真相原原本本展现给读者。